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糧食的溫度降低到負(fù)值(冰凍)是冷卻的第二階段。這可保證糧食休眠和長期儲藏的效果。但是，在這個情況下，潮濕的糧食自由水凍結(jié)，形成冰晶，引起細(xì)胞破壞和胚死亡。在冰凍條件下，干糧食的發(fā)芽率不降低，因為結(jié)合水沒有凍結(jié)。根據(jù)這個原理，制定了特別珍貴的種子在液態(tài)氮中，當(dāng)溫度為—196℃條件下儲藏數(shù)年的方法。
春季，在過冷的糧食中表面可能很濕潤，因此，有一層糧食發(fā)熱。所以，糧食種籽不提倡冷到-3--5℃以下，這并不意味著，冬季對糧食使用專門的加溫辦法沒有必要。
糧食呼吸的強度和特性與糧粒空間空氣的成分有關(guān)。只有存在氧氣時才有可能是正常的，即高水分糧食的需氧呼吸才能進(jìn)行，在糧食的組織中積蓄著酒精，種籽的生命活動很快喪失。但是，這種糧食的食用和飼用價值沒有明顯變化。由于厭氧呼吸時排出的熱量大約少30倍，有害的微生物不能夠很快發(fā)展，糧食密閉和缺氧儲藏是飼用潮濕糧食防腐的一個工藝方法。
干糧食的呼吸強度很小，經(jīng)受高濃度的二氧化碳沒有明顯的副作用，長時間儲藏完全沒有氧氣。糧食的成熟度，飽滿度，受損度，被有機雜質(zhì)的污染度對其呼吸的影響很大。未成熟糧粒，即使把它們烘干，其呼吸強度仍比成熟糧粒強2—3倍。儲藏時未成熟糧粒不很穩(wěn)定，經(jīng)常有高的水分，微生物在其中很快發(fā)展。
不飽滿糧粒與正常糧粒相比，有相對大的表皮面積和高的吸濕性，呼吸強度很大，儲藏時不很穩(wěn)定。這種情況在發(fā)芽糧粒和有機械損傷的糧粒中可觀察到。
這樣，為了提高糧食儲藏的穩(wěn)定性，必須在糧食收獲以后，使用清理和分級的方法，盡可能快地從糧食中分離出所有呼吸強度大的雜質(zhì)。分離出來的質(zhì)量差的糧食雜質(zhì)送往飼科廠加工，或者單獨存放。
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