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分子剪刀改造微藻基因組 助推第三代生物燃料研發(fā)

來源:環(huán)球糧機(jī)網(wǎng)發(fā)布時(shí)間:2015-04-28 13:57:13

近日,法國大型生物技術(shù)公司Cellectis總裁安德烈·舒利卡先生(Andre Choulika)表示,從現(xiàn)在起到2013年1月公司將證明基因組改造能使用微藻來制造第三代生物燃料。目前Cellectis公司應(yīng)主要證明其技術(shù)在藻類植物中的有效性。


Cellectis公司研發(fā)了能夠干預(yù)脫氧核糖核酸(ADN)的分子剪刀,通過此分子剪刀,公司能夠改變或更換疾病突變載體基因,并改變植物機(jī)體。該公司還負(fù)責(zé)實(shí)現(xiàn)分子剪刀的商業(yè)化。公司已經(jīng)將該技術(shù)推廣到生物生產(chǎn)、農(nóng)業(yè)和醫(yī)藥行業(yè)的學(xué)術(shù)研究中。

基因組改造實(shí)驗(yàn)如果成功,從2013年1月起的未來四年內(nèi)公司將在法國石油化工集團(tuán)道達(dá)爾公司(Total)的協(xié)助下進(jìn)行石油代用品的試驗(yàn)生產(chǎn)。該階段的投資金額將達(dá)到數(shù)百萬歐元。

根據(jù)雙方簽訂的協(xié)議,Cellectis公司和道達(dá)爾公司將共同支付該項(xiàng)目所需的成本。目前,兩家公司均沒有透漏相關(guān)的財(cái)務(wù)信息。從2012年2月起十名研究人員就已經(jīng)開始共同從事該項(xiàng)目的研究,此外,兩家公司將分別持有相關(guān)技術(shù)和產(chǎn)品50%的份額。舒利卡先生表示,在最初幾年內(nèi),該項(xiàng)目每年的開發(fā)成本將至少為數(shù)百萬歐元。而在試點(diǎn)階段,所需金額將達(dá)到數(shù)千萬歐元。

基因組改造技術(shù)

普魯蘭酶基因克隆表達(dá)及枯草芽孢桿菌基因組的改造[1]

根據(jù)整合到基因組上的目的基因來源,分別構(gòu)建了兩種整合方式的載體,即單交換和雙交換整合載體。對(duì)于枯草芽孢桿菌本身來源的巰基-二硫鍵氧化還原酶基因bdbC,bdbD,直接將其作為同源片斷,由于bdbC,bdbD共用一個(gè)啟動(dòng)子,在基因組上以操縱子的形式存在,因此構(gòu)建的單交換載體命名為pACC-BdbDC。對(duì)于大腸桿菌來源的巰基-二硫鍵氧化還原酶基因ds.C,dsbD,dsbE,dsbG,則需要在枯草芽孢桿菌基因組上選擇整合位點(diǎn),在其整合位點(diǎn)附近各選取500bp基因作為同源片斷,克隆到pBSK-p1p4-Cm上,構(gòu)建了基因敲除載體。再將dsbC,dsbD,dsbE,dsbG插入到該載體的兩個(gè)同源片斷之間,分別構(gòu)建了雙交換載體pDGC和pDsbE。將以上構(gòu)建好的單交換和雙交換載體分別轉(zhuǎn)化枯草芽孢桿菌B.su.168,結(jié)果巰基-二硫鍵氧化還原酶基因整合到枯草芽孢桿菌基因組上,成功改造了枯草芽孢桿菌遺傳背景。

戊型肝炎病毒SAAS-JDY5株基因組全長cDNA的構(gòu)建及其改造[2]

傳統(tǒng)的以限制性內(nèi)切酶和連接酶為基礎(chǔ)的DNA重組技術(shù)曾經(jīng)革命性地推動(dòng)了分子生物學(xué)和遺傳工程的發(fā)展,至今仍然發(fā)揮著重要作用。但是實(shí)驗(yàn)室原有的片段太多,找酶切位點(diǎn)比較困難。用overlap pcr連成4個(gè)長片段后就相對(duì)容易一些,利用4626位置上的KpnⅠ和載體上的XbaⅠ這兩個(gè)酶切位點(diǎn)將中間兩段連接,從而形成3個(gè)大片段(1~2474,2094~6645,5186~7232)。In-fusion法的原理跟基因同源重組類似,利用DNA片段的同源關(guān)系將目的片段定向地插入載體中。這個(gè)方法只需一個(gè)單一的酶切位點(diǎn)將載體線性化即可,不需要兩個(gè)單一的酶切位點(diǎn),條件沒有前面苛刻,所以結(jié)合這個(gè)方法用于最后兩步連接。先利用載體上的XbaⅠ酶切位點(diǎn)將前兩段連接(1~5318),然后利用5245位置上的FseⅠ酶切位點(diǎn)將最后兩段連成HEV的全長cDNA。In-fusion法需要重新設(shè)計(jì)引物,使目的基因的兩端帶有載體兩端的同源序列。雖然也涉及到PCR過程,但是以質(zhì)粒為模板,難度相對(duì)overlap PCR要小,可以擴(kuò)增3kb左右大小的片段用于連接。

為了保證這個(gè)HEV的全長cDNA克隆具有感染性,又對(duì)它進(jìn)行了修正。在測(cè)序之后發(fā)現(xiàn)5’端有94個(gè)堿基與原序列比對(duì)不上,另外在2467的位置多出了5個(gè)堿基,我們需要將這一段替換掉。為了保證序列的準(zhǔn)確性,重新從病料中提取SAAS-JDY5株的RNA,進(jìn)行反轉(zhuǎn)錄(RT-PCR)。設(shè)計(jì)套式特異性引物,并在5’端引入T7 RNA聚合酶啟動(dòng)子,進(jìn)行巢式PCR(Nest-PCR)擴(kuò)增出目的片段,用新的正確的片段替換掉原來錯(cuò)誤的片段,獲得正確的SAAS-JDY5株HEV的全長cDNA克隆。

基于基因組DNA誘變的遺傳重組改造乙醇工業(yè)酵母的耐熱性及發(fā)酵性能[3]

通過化學(xué)誘變和基于基因組DNA誘變的遺傳重組技術(shù)對(duì)乙醇工業(yè)酵母菌的溫度適應(yīng)性進(jìn)行改造,獲得耐熱性能和發(fā)酵性能得到提高的重組釀酒酵母 Saccharomyces cerevisiae T44-2。重組菌株T44-2的最高生長溫度比原始菌株CE6提高了3℃,48℃和52℃熱激處理1 h,重組菌株的細(xì)胞存活率分別是原始菌株的1.84和1.87倍。重組菌株在30℃~40℃范圍內(nèi)具有良好的糖醇轉(zhuǎn)化率和乙醇產(chǎn)量,發(fā)酵200g/L葡萄 糖能夠產(chǎn)生83.8~91.2 g/L乙醇。重組菌株在43℃和44℃發(fā)酵時(shí)乙醇產(chǎn)量仍分別有69.2 g/L和52.6g/L,而此時(shí)原始菌株基本沒有活性。研究結(jié)果為釀酒酵母在乙醇高溫發(fā)酵中的應(yīng)用奠定了基礎(chǔ),可極大降低冷卻成本。

生物燃料研究

生物燃料最新發(fā)展態(tài)勢(shì)分析[4]

第一代生物燃料的生產(chǎn)工藝已經(jīng)較為成熟,美國、歐盟和巴西等一些國家已經(jīng)形成了較完善的產(chǎn)業(yè)鏈。以纖維素乙醇為代表的第二代生物燃料是更有希望的替代燃料,但目前還未獲得關(guān)鍵性的技術(shù)突破,其大規(guī)模的商業(yè)化生產(chǎn)尚待時(shí)日。目前生物燃料正處于從第一代向第二代發(fā)展過渡的初期。各國紛紛將發(fā)展第二代生物燃料定為國策,為此制訂了長期的發(fā)展規(guī)劃與目標(biāo),并為生物燃料發(fā)展提供了良好的政策環(huán)境和大力的經(jīng)費(fèi)支持。各相關(guān)研究機(jī)構(gòu)與企業(yè)也積極行動(dòng),力圖解決生物燃料發(fā)展的各個(gè)關(guān)鍵問題。在此過程中,一些與生物燃料可持續(xù)發(fā)展有關(guān)的重要問題也引起了人們的關(guān)注。

利用藻類生物質(zhì)制備生物燃料研究進(jìn)展[5]

生物柴油和生物質(zhì)油的可持續(xù)健康穩(wěn)定發(fā)展,必須有穩(wěn)定和優(yōu)質(zhì)的原料來源。藻類生物質(zhì)即是生產(chǎn)生物燃料的優(yōu)良原料。本論文介紹了微藻的概念,綜述了利用微藻制備生物柴油和生物質(zhì)油的國內(nèi)外研究進(jìn)展,尤其是制備微藻方面的生物基因工程、新反應(yīng)器和聯(lián)產(chǎn)技術(shù),以及微藻直接熱解制備生物質(zhì)油和直接燃燒利用的技術(shù)。探討了利用微藻制備生物燃料的優(yōu)點(diǎn)和存在的問題。

Cellectis公司的舉動(dòng)

法國Cellectis公司獲得日本Tobacco公司Pureintro技術(shù)授權(quán)

法國基因技術(shù)公司Cellectis公司的美國分公司Cellectis Plant Sciences(位于明尼蘇達(dá)州圣保羅)獲得了日本Tobacco公司授權(quán),獲準(zhǔn)使用Tobacco公司的土壤桿菌介質(zhì)轉(zhuǎn)化植入技術(shù) PureIntro,celletics公司將可以使用這個(gè)技術(shù)來研發(fā)轉(zhuǎn)基因玉米和水稻產(chǎn)品。

Cellctis 公司在大范圍核酸酶基因工程研究領(lǐng)域處于領(lǐng)先地位,它的許多研究成果被成功運(yùn)用于多種作物上,能對(duì)基因序列進(jìn)行插入,刪除或者改性操作,使得植物能表達(dá)出 新的性狀(比如抗旱,提高營養(yǎng)成分,抗病害等),美國分公司Cellectis plant sciences是于今年剛剛成立的,負(fù)責(zé)基因工程涉農(nóng)領(lǐng)域的全面研究。

Cellectis推出源于人誘導(dǎo)多能干細(xì)胞(iPS)的肝細(xì)胞產(chǎn)品

法國生物公司Cellectis集團(tuán)下的Cellectis干細(xì)胞部宣布推出來源于人誘導(dǎo)多能干細(xì)胞(iPS)的肝細(xì)胞產(chǎn)品,即hiPS-HEP。hiPS-HEP具同質(zhì)性、再生性及生命周期長且CYP活性穩(wěn)定的特點(diǎn),能夠?yàn)樗幬锇l(fā)現(xiàn)、毒性試驗(yàn)與疫苗研發(fā)等一系列體外研究提供理想的平臺(tái)。

Cellectis干細(xì)胞部首席科學(xué)家(CSO)Johan Hyllner表示,各醫(yī)藥產(chǎn)業(yè)間的的高度相關(guān)性會(huì)使hiPS-HEP成為頗具前景的研發(fā)系統(tǒng)。“制藥企業(yè)迫切需要應(yīng)用于藥物研制早期更佳的、與臨床相關(guān)性更高的模型,以評(píng)價(jià)肝毒性、發(fā)現(xiàn)新的藥物靶點(diǎn)及研發(fā)新疫苗,”Hyllner 補(bǔ)充道。hiPS-HEP來源于人誘導(dǎo)多能干細(xì)胞(iPS),嚴(yán)格依照質(zhì)量控制和倫理批準(zhǔn)程序。

[1] 胡海紅.普魯蘭酶基因克隆表達(dá)及枯草芽孢桿菌基因組的改造. 生物化學(xué)與分子生物學(xué). 2009

[2] 王茜.戊型肝炎病毒SAAS-JDY5株基因組全長cDNA的構(gòu)建及其改造. 南京農(nóng)業(yè)大學(xué). 2010

[3] 劉秀穎,何秀萍,盧瑩,張博潤.基于基因組DNA誘變的遺傳重組改造乙醇工業(yè)酵母的耐熱性及發(fā)酵性能. 生物工程學(xué)報(bào). 2011

[4] 鄧勇,房俊民,陳方,陳云偉,王春明.生物燃料最新發(fā)展態(tài)勢(shì)分析[J]. 中國生物工程雜志. 2008

[5] 嵇磊, 張利雄, 姚志龍, 閔恩澤.利用藻類生物質(zhì)制備生物燃料研究進(jìn)展[J].石油學(xué)報(bào).2007

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