1、分級(jí)儲(chǔ)藏。

   棉籽的耐儲(chǔ)性與收獲期有很大關(guān)系。霜降前收獲的棉籽較易保管；霜降后收獲的棉籽不宜長期儲(chǔ)藏。因此，這兩種棉籽要盡可能分開儲(chǔ)藏。此外，棉籽還應(yīng)根據(jù)水分高低分級(jí)儲(chǔ)藏。棉籽的安全水分冬季為14%，春秋季為13%，夏季為12%。

   通常水分12%以下的棉籽，在冬季趁低溫堆垛或入倉，可較長期儲(chǔ)藏；水分12--13%的棉籽，一般只宜短期儲(chǔ)藏，而且必須加強(qiáng)檢查，掌握堆內(nèi)溫度變化情況，如有發(fā)熱現(xiàn)象，要及時(shí)加工或通風(fēng)、曝曬、降溫散熱。

   2、不同棉籽分別儲(chǔ)藏。

   毛棉籽具有較高的抗潮、抗壓及密閉性能，可以進(jìn)行露天儲(chǔ)藏，但脫絨棉或種用棉籽，仍以庫內(nèi)儲(chǔ)藏為宜。

   ①毛棉籽露天儲(chǔ)藏：毛棉籽露天儲(chǔ)存，要選擇好地基（地勢高，通風(fēng)排水良好），因地制宜做好垛底鋪墊工作，并將棉籽水分降至12%以下，然后選擇氣溫較低的天氣進(jìn)行堆垛。堆垛的形狀，一般底部為長方形，上部為橢圓形。大垛可儲(chǔ)存棉籽20萬公斤，小垛約儲(chǔ)存棉籽8--10萬公斤（每立方米毛棉籽約260公斤）。

   棉籽露天不苫蓋儲(chǔ)藏，根據(jù)湖北省棉區(qū)的經(jīng)驗(yàn)，從10至12月，一般保持原有垛溫，第二年1--2月垛溫逐漸下降，3--4月逐漸隨氣溫回升，但上升緩慢，從第一年10月至第二年4月為安全期，5月就開始進(jìn)入不安全期。在儲(chǔ)藏期間，棉籽水分變化很小，雨后檢查，一般僅表層棉籽透濕1--2粒，天氣轉(zhuǎn)晴，水分很快蒸發(fā)。但須注意的是垛面由于受雨，經(jīng)過干濕變化，容易變松，鳥雀取食，也易造成垛面不平整，故須在儲(chǔ)藏期間經(jīng)常檢查，在風(fēng)雨天后更應(yīng)注意檢查，發(fā)現(xiàn)變形，應(yīng)及時(shí)拍打平整堅(jiān)實(shí)，以防雨水浸入。

   ②脫絨棉籽（光籽）由于皮殼受損，防潮性差，易受外界環(huán)境影響，一般不宜直接露天存放，但可采用脫絨棉籽堆垛外圍覆蓋毛棉籽的方法露天儲(chǔ)存，但對(duì)發(fā)芽率稍有影響，在實(shí)踐中如嚴(yán)格控制棉光籽水分在10--12%，趁低溫季節(jié)堆垛，并加強(qiáng)管理，保持垛身緊密無縫，是能保持脫絨棉籽在露天安全儲(chǔ)藏的。

   ③露天儲(chǔ)藏的注意事項(xiàng)：在露天儲(chǔ)藏過程中，要隨時(shí)注意保持垛面堅(jiān)實(shí)光滑，防止漏雨及鳥雀取食使垛變松。在梅雨季節(jié)，要做好防潮、防漏工作。同時(shí)要加強(qiáng)檢查，注意垛溫變化。檢測垛溫時(shí)，溫度計(jì)要自下而上斜插入垛內(nèi)，使洞口向下，防止雨水浸入。如遇局部發(fā)熱、局部浸水時(shí)，可將棉籽局部挖出處理，然后用干棉籽填補(bǔ)挖出的洞口，而且必須與原垛棉籽結(jié)成一整體，并拍打結(jié)實(shí)，保持垛面緊密、平整、光滑。如垛溫高出氣溫，全垛有發(fā)熱趨勢，即應(yīng)進(jìn)行處理。處理的方法，冬季可進(jìn)行倒垛，春季可利用晴天早晚倒垛通風(fēng)，夏季可進(jìn)行灌包碼通風(fēng)垛或提前發(fā)出加工。干燥棉籽容易自燃，保管中要注意防火，防止在密閉的情況下棉籽堆內(nèi)產(chǎn)生的熱量不易散發(fā)，逐漸積聚達(dá)到一定溫度而自燃。故在大型棉籽垛中最好埋設(shè)一些編織的通風(fēng)籠，，以利于散熱降溫，防止自燃。此外，還要做好防蟲防鼠工作，棉籽儲(chǔ)藏期間的主要害蟲是棉花紅鈴蟲，能降低棉籽的出油率，是檢疫對(duì)象，發(fā)現(xiàn)蟲害后可用磷化鋁進(jìn)行熏蒸處理。另外發(fā)現(xiàn)老鼠危害，應(yīng)用滅鼠劑進(jìn)行防治。